IMFエージェントのイーサン・ハント（トム・クルーズ）は、ロシアのクレムリンに潜入し、”コバルト”と呼ばれる男についての情報を入手するというミッションに参加する。だが、彼らのミッション中に別の何者かがクレムリンを爆破。 ロシアとの関係悪化を恐れ…